Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT6

SSX6, Putative protein SSX6, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX6Q7RTT6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SSX6Q7RTT6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms