Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF7

NXPE4, NXPE family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE4Q6UWF7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXPE4Q6UWF7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXPE4Q6UWF7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXPE4Q6UWF7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXPE4Q6UWF7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXPE4Q6UWF7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXPE4Q6UWF7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXPE4Q6UWF7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXPE4Q6UWF7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXPE4Q6UWF7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXPE4Q6UWF7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXPE4Q6UWF7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXPE4Q6UWF7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXPE4Q6UWF7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NXPE4Q6UWF7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NXPE4Q6UWF7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NXPE4Q6UWF7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NXPE4Q6UWF7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NXPE4Q6UWF7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NXPE4Q6UWF7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXPE4Q6UWF7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms