Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SHEQ5VZ18 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHEQ5VZ18 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms