Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms