Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATAD3BQ5T9A4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms