Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms