Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNT2

TMEM201, Transmembrane protein 201, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM201Q5SNT2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM201Q5SNT2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM201Q5SNT2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms