Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBRG1Q3YBR2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBRG1Q3YBR2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms