Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM71Q2Q1W2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms