Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC142Q17RM4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms