Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPROQ16827 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPROQ16827 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
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