Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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