Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
AP3B2Q13367 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AP3B2Q13367 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AP3B2Q13367 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AP3B2Q13367 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3B2Q13367 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3B2Q13367 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3B2Q13367 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3B2Q13367 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3B2Q13367 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3B2Q13367 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3B2Q13367 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3B2Q13367 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3B2Q13367 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3B2Q13367 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP3B2Q13367 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP3B2Q13367 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP3B2Q13367 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP3B2Q13367 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP3B2Q13367 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AP3B2Q13367 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AP3B2Q13367 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AP3B2Q13367 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AP3B2Q13367 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AP3B2Q13367 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AP3B2Q13367 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP3B2Q13367 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
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