Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL28Q13084 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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