Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms