Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUCB1Q02818 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms