Protein–RNA interactions for Protein: Q01459

CTBS, Di-N-acetylchitobiase, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBSQ01459 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTBSQ01459 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTBSQ01459 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms