Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSG6Q00889 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSG6Q00889 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSG6Q00889 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PSG6Q00889 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSG6Q00889 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSG6Q00889 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSG6Q00889 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSG6Q00889 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSG6Q00889 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSG6Q00889 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSG6Q00889 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSG6Q00889 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSG6Q00889 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSG6Q00889 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSG6Q00889 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSG6Q00889 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSG6Q00889 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSG6Q00889 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSG6Q00889 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSG6Q00889 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSG6Q00889 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms