Protein–RNA interactions for Protein: P78549

NTHL1, Endonuclease III-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTHL1P78549 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NTHL1P78549 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NTHL1P78549 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NTHL1P78549 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NTHL1P78549 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms