Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSX2P58304 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSX2P58304 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSX2P58304 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSX2P58304 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSX2P58304 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
VSX2P58304 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
VSX2P58304 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VSX2P58304 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VSX2P58304 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VSX2P58304 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VSX2P58304 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VSX2P58304 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VSX2P58304 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VSX2P58304 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VSX2P58304 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VSX2P58304 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VSX2P58304 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VSX2P58304 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VSX2P58304 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VSX2P58304 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VSX2P58304 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VSX2P58304 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VSX2P58304 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VSX2P58304 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VSX2P58304 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VSX2P58304 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VSX2P58304 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VSX2P58304 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VSX2P58304 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VSX2P58304 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VSX2P58304 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VSX2P58304 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VSX2P58304 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VSX2P58304 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VSX2P58304 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VSX2P58304 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VSX2P58304 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VSX2P58304 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VSX2P58304 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VSX2P58304 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VSX2P58304 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VSX2P58304 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VSX2P58304 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VSX2P58304 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VSX2P58304 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VSX2P58304 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VSX2P58304 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VSX2P58304 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VSX2P58304 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VSX2P58304 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VSX2P58304 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VSX2P58304 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VSX2P58304 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VSX2P58304 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VSX2P58304 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VSX2P58304 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VSX2P58304 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VSX2P58304 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VSX2P58304 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VSX2P58304 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VSX2P58304 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VSX2P58304 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VSX2P58304 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VSX2P58304 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VSX2P58304 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VSX2P58304 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VSX2P58304 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VSX2P58304 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VSX2P58304 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VSX2P58304 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VSX2P58304 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VSX2P58304 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VSX2P58304 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VSX2P58304 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VSX2P58304 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VSX2P58304 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VSX2P58304 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VSX2P58304 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VSX2P58304 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VSX2P58304 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VSX2P58304 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VSX2P58304 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VSX2P58304 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VSX2P58304 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VSX2P58304 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VSX2P58304 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VSX2P58304 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VSX2P58304 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VSX2P58304 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VSX2P58304 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VSX2P58304 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VSX2P58304 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VSX2P58304 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VSX2P58304 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VSX2P58304 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VSX2P58304 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VSX2P58304 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VSX2P58304 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VSX2P58304 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms