Protein–RNA interactions for Protein: P58294

PROK1, Prokineticin-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1P58294 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PROK1P58294 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PROK1P58294 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PROK1P58294 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PROK1P58294 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PROK1P58294 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PROK1P58294 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PROK1P58294 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PROK1P58294 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PROK1P58294 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PROK1P58294 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PROK1P58294 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PROK1P58294 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PROK1P58294 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PROK1P58294 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PROK1P58294 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PROK1P58294 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PROK1P58294 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PROK1P58294 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PROK1P58294 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PROK1P58294 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PROK1P58294 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PROK1P58294 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PROK1P58294 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PROK1P58294 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PROK1P58294 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PROK1P58294 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PROK1P58294 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PROK1P58294 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PROK1P58294 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PROK1P58294 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PROK1P58294 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PROK1P58294 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PROK1P58294 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PROK1P58294 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PROK1P58294 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PROK1P58294 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PROK1P58294 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PROK1P58294 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PROK1P58294 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PROK1P58294 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PROK1P58294 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PROK1P58294 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PROK1P58294 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PROK1P58294 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PROK1P58294 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PROK1P58294 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PROK1P58294 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PROK1P58294 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PROK1P58294 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PROK1P58294 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PROK1P58294 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PROK1P58294 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PROK1P58294 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PROK1P58294 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PROK1P58294 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PROK1P58294 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PROK1P58294 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PROK1P58294 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PROK1P58294 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PROK1P58294 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PROK1P58294 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PROK1P58294 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PROK1P58294 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PROK1P58294 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PROK1P58294 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PROK1P58294 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PROK1P58294 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PROK1P58294 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PROK1P58294 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PROK1P58294 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PROK1P58294 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PROK1P58294 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PROK1P58294 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PROK1P58294 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PROK1P58294 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PROK1P58294 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PROK1P58294 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PROK1P58294 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PROK1P58294 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PROK1P58294 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PROK1P58294 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PROK1P58294 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PROK1P58294 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PROK1P58294 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PROK1P58294 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PROK1P58294 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PROK1P58294 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PROK1P58294 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PROK1P58294 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PROK1P58294 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PROK1P58294 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PROK1P58294 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PROK1P58294 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PROK1P58294 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PROK1P58294 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PROK1P58294 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PROK1P58294 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PROK1P58294 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PROK1P58294 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms