Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPD52P55327 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPD52P55327 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPD52P55327 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPD52P55327 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPD52P55327 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPD52P55327 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TPD52P55327 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPD52P55327 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPD52P55327 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPD52P55327 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPD52P55327 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPD52P55327 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPD52P55327 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPD52P55327 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPD52P55327 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPD52P55327 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPD52P55327 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPD52P55327 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPD52P55327 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPD52P55327 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPD52P55327 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPD52P55327 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPD52P55327 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPD52P55327 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPD52P55327 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TPD52P55327 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TPD52P55327 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPD52P55327 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPD52P55327 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPD52P55327 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPD52P55327 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPD52P55327 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPD52P55327 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPD52P55327 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPD52P55327 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPD52P55327 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPD52P55327 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPD52P55327 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TPD52P55327 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPD52P55327 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPD52P55327 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPD52P55327 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPD52P55327 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPD52P55327 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPD52P55327 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPD52P55327 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPD52P55327 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPD52P55327 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TPD52P55327 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPD52P55327 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPD52P55327 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPD52P55327 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPD52P55327 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPD52P55327 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPD52P55327 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPD52P55327 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPD52P55327 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPD52P55327 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPD52P55327 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPD52P55327 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPD52P55327 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPD52P55327 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPD52P55327 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPD52P55327 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPD52P55327 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPD52P55327 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPD52P55327 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TPD52P55327 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPD52P55327 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPD52P55327 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPD52P55327 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPD52P55327 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPD52P55327 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPD52P55327 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPD52P55327 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPD52P55327 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPD52P55327 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPD52P55327 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPD52P55327 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPD52P55327 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPD52P55327 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPD52P55327 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPD52P55327 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPD52P55327 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPD52P55327 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPD52P55327 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPD52P55327 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TPD52P55327 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPD52P55327 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TPD52P55327 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPD52P55327 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPD52P55327 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TPD52P55327 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPD52P55327 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPD52P55327 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPD52P55327 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPD52P55327 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPD52P55327 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPD52P55327 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms