Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLTPP55058 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLTPP55058 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PLTPP55058 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLTPP55058 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLTPP55058 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLTPP55058 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLTPP55058 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLTPP55058 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLTPP55058 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLTPP55058 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLTPP55058 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLTPP55058 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLTPP55058 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLTPP55058 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLTPP55058 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLTPP55058 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLTPP55058 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLTPP55058 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLTPP55058 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLTPP55058 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLTPP55058 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLTPP55058 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLTPP55058 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLTPP55058 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLTPP55058 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PLTPP55058 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLTPP55058 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLTPP55058 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLTPP55058 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLTPP55058 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLTPP55058 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLTPP55058 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLTPP55058 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLTPP55058 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLTPP55058 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLTPP55058 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLTPP55058 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLTPP55058 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLTPP55058 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLTPP55058 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PLTPP55058 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLTPP55058 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLTPP55058 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLTPP55058 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLTPP55058 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLTPP55058 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLTPP55058 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PLTPP55058 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLTPP55058 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLTPP55058 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLTPP55058 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLTPP55058 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLTPP55058 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLTPP55058 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLTPP55058 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLTPP55058 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLTPP55058 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLTPP55058 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLTPP55058 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLTPP55058 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLTPP55058 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLTPP55058 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLTPP55058 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLTPP55058 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLTPP55058 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLTPP55058 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLTPP55058 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLTPP55058 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLTPP55058 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLTPP55058 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PLTPP55058 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLTPP55058 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLTPP55058 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLTPP55058 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLTPP55058 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLTPP55058 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLTPP55058 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLTPP55058 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLTPP55058 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PLTPP55058 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLTPP55058 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLTPP55058 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PLTPP55058 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLTPP55058 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLTPP55058 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLTPP55058 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLTPP55058 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLTPP55058 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLTPP55058 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLTPP55058 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLTPP55058 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLTPP55058 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLTPP55058 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLTPP55058 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLTPP55058 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLTPP55058 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLTPP55058 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLTPP55058 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLTPP55058 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms