Protein–RNA interactions for Protein: P52738

ZNF140, Zinc finger protein 140, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF140P52738 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF140P52738 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms