Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.151e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 PIN1-209ENST00000590540 702 ntTSL 313.92□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 RALA-201ENST00000005257 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.21e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 MED29-207ENST00000615911 3565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 MED29-201ENST00000315588 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 CUX1-210ENST00000497815 947 ntTSL 212.78□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 41.2
AARSP49588 RAPGEF6-209ENST00000510071 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 CLN6-217ENST00000636964 3335 ntTSL 212.49□□□□□ -0.411e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 USP19-204ENST00000398896 3907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)12.02□□□□□ -0.491e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 PIN1-210ENST00000591777 533 ntTSL 311.9□□□□□ -0.51e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 KDELR2-205ENST00000463747 376 ntTSL 511.5□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 TSC1-207ENST00000493467 2219 ntTSL 1 (best)10.79□□□□□ -0.681e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 KDELR2-202ENST00000382267 583 ntTSL 410.67□□□□□ -0.71e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 DIP2A-202ENST00000417564 6967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.721e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 RAPGEF6-215ENST00000627212 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.731e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 RAPGEF6-214ENST00000515170 4103 ntTSL 210.03□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 AL662884.1-201ENST00000559458 662 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 KDELR2-204ENST00000462052 382 ntTSL 28.64□□□□□ -1.031e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 DHRSX-204ENST00000441131 539 ntTSL 28.27□□□□□ -1.091e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.111e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.191e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.331e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.341e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 MPC1-205ENST00000487218 918 ntTSL 56.26□□□□□ -1.411e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.691e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 DSCR4-203ENST00000482032 799 ntTSL 33.85□□□□□ -1.791e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.831e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.011e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 MPC1-204ENST00000475708 651 ntTSL 52.49□□□□□ -2.011e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 RAPGEF6-203ENST00000503398 149 ntTSL 52.16□□□□□ -2.061e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.21e-6■■■■■ 40.9
AARSP49588 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.641e-6■■■■■ 40.9
AARSP49588 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.287e-12■■■■■ 40.7
AARSP49588 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.742e-6■■■■■ 40.7
AARSP49588 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.532e-6■■■■■ 40.7
AARSP49588 TRAPPC10-203ENST00000422875 5267 ntTSL 1 (best)18.4■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 40.7
AARSP49588 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 40.7
AARSP49588 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 40.7
AARSP49588 CPSF4-206ENST00000441580 942 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 40.7
AARSP49588 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.321e-7■■■■■ 40.7
AARSP49588 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.371e-7■■■■■ 40.7
AARSP49588 SEC14L1-201ENST00000392476 2957 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 40.7
AARSP49588 SEC14L1-205ENST00000443798 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 40.7
AARSP49588 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 40.5
AARSP49588 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 40.5
AARSP49588 MARCH6-202ENST00000449913 3062 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 40.4
AARSP49588 MARCH6-204ENST00000503788 2874 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 40.4
AARSP49588 MARCH6-210ENST00000511802 4734 ntTSL 27.95□□□□□ -1.141e-6■■■■■ 40.4
AARSP49588 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.251e-6■■■■■ 40.4
AARSP49588 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.561e-7■■■■■ 40.2
AARSP49588 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.371e-7■■■■■ 40.2
AARSP49588 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.651e-7■■■■■ 40.2
AARSP49588 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 40.2
AARSP49588 AGAP3-214ENST00000476375 1019 ntTSL 514.22□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 39.9
AARSP49588 SRRM2-226ENST00000576415 461 ntTSL 227.8■■■□□ 2.041e-6■■■■■ 39.8
AARSP49588 SRRM2-223ENST00000575701 860 ntTSL 327.42■■□□□ 1.981e-6■■■■■ 39.8
AARSP49588 SRRM2-219ENST00000574340 579 ntTSL 319.28■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 39.8
AARSP49588 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.531e-7■■■■■ 39.3
AARSP49588 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.266e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.136e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 MBOAT7-214ENST00000495968 465 ntTSL 528.18■■■□□ 2.16e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.876e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.86e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.456e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 CPEB1-205ENST00000569257 527 ntTSL 423.22■■□□□ 1.316e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.36e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 MBOAT7-206ENST00000437868 2033 ntTSL 1 (best)22.62■■□□□ 1.216e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 MBOAT7-204ENST00000414665 876 ntTSL 222.14■■□□□ 1.136e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 NECAB3-217ENST00000606106 591 ntTSL 421.36■■□□□ 1.016e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.966e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 MBOAT7-210ENST00000474910 629 ntTSL 220.83■□□□□ 0.936e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.96e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 FN3KRP-207ENST00000574832 1422 ntTSL 220.43■□□□□ 0.866e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.836e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 CPEB1-203ENST00000567678 557 ntTSL 420.18■□□□□ 0.826e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 FN3KRP-206ENST00000574356 887 ntTSL 519.99■□□□□ 0.796e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.716e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 MBOAT7-211ENST00000491216 564 ntTSL 218.79■□□□□ 0.66e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 NECAB3-208ENST00000480994 732 ntTSL 518.38■□□□□ 0.536e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 FN3KRP-204ENST00000573158 627 ntTSL 317.95■□□□□ 0.466e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.456e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.446e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 FN3KRP-205ENST00000574206 683 ntTSL 317.68■□□□□ 0.426e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.426e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.326e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 SUPT16H-205ENST00000556217 1027 ntTSL 216.79■□□□□ 0.286e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 BCL2L12-207ENST00000598979 893 ntTSL 316.27■□□□□ 0.26e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 MAD1L1-223ENST00000496548 639 ntTSL 515.7■□□□□ 0.16e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.036e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 SUPT16H-208ENST00000557652 877 ntTSL 515.23■□□□□ 0.036e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 06e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 MBOAT7-208ENST00000453320 557 ntTSL 414.31□□□□□ -0.126e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC13.48□□□□□ -0.256e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 FN3KRP-209ENST00000577128 515 ntTSL 513.47□□□□□ -0.256e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 BCL2L12-213ENST00000619007 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.286e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 AACSP1-201ENST00000503486 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.376e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 CPEB1-215ENST00000617958 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.446e-8■■■■■ 39.3
AARSP49588 CPEB1-207ENST00000611031 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.616e-8■■■■■ 39.3
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