Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMPOP42166 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMPOP42166 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMPOP42166 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMPOP42166 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMPOP42166 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TMPOP42166 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TMPOP42166 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TMPOP42166 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TMPOP42166 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TMPOP42166 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMPOP42166 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMPOP42166 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMPOP42166 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMPOP42166 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMPOP42166 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMPOP42166 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMPOP42166 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMPOP42166 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMPOP42166 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMPOP42166 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMPOP42166 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMPOP42166 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMPOP42166 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMPOP42166 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMPOP42166 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMPOP42166 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TMPOP42166 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMPOP42166 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMPOP42166 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMPOP42166 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMPOP42166 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMPOP42166 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMPOP42166 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMPOP42166 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMPOP42166 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TMPOP42166 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TMPOP42166 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TMPOP42166 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TMPOP42166 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TMPOP42166 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMPOP42166 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMPOP42166 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMPOP42166 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMPOP42166 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMPOP42166 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMPOP42166 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMPOP42166 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TMPOP42166 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMPOP42166 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMPOP42166 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMPOP42166 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMPOP42166 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMPOP42166 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMPOP42166 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TMPOP42166 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMPOP42166 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMPOP42166 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMPOP42166 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMPOP42166 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMPOP42166 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMPOP42166 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMPOP42166 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TMPOP42166 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
TMPOP42166 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TMPOP42166 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TMPOP42166 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TMPOP42166 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TMPOP42166 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TMPOP42166 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TMPOP42166 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TMPOP42166 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMPOP42166 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMPOP42166 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMPOP42166 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMPOP42166 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TMPOP42166 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMPOP42166 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMPOP42166 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMPOP42166 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMPOP42166 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMPOP42166 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMPOP42166 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMPOP42166 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMPOP42166 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMPOP42166 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMPOP42166 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMPOP42166 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMPOP42166 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMPOP42166 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMPOP42166 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMPOP42166 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMPOP42166 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMPOP42166 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMPOP42166 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMPOP42166 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMPOP42166 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMPOP42166 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMPOP42166 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMPOP42166 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms