Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6V1E1P36543 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms