Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms