Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNCP24863 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNCP24863 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNCP24863 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNCP24863 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNCP24863 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNCP24863 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNCP24863 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNCP24863 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNCP24863 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNCP24863 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNCP24863 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNCP24863 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNCP24863 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNCP24863 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNCP24863 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNCP24863 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNCP24863 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNCP24863 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNCP24863 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNCP24863 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNCP24863 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNCP24863 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNCP24863 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNCP24863 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNCP24863 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNCP24863 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNCP24863 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNCP24863 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNCP24863 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNCP24863 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNCP24863 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNCP24863 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNCP24863 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNCP24863 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNCP24863 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNCP24863 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNCP24863 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNCP24863 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNCP24863 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNCP24863 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNCP24863 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNCP24863 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNCP24863 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNCP24863 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNCP24863 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNCP24863 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNCP24863 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNCP24863 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNCP24863 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNCP24863 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNCP24863 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNCP24863 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNCP24863 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNCP24863 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNCP24863 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNCP24863 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNCP24863 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNCP24863 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNCP24863 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNCP24863 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNCP24863 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNCP24863 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNCP24863 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNCP24863 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNCP24863 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNCP24863 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNCP24863 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNCP24863 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNCP24863 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNCP24863 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNCP24863 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNCP24863 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNCP24863 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNCP24863 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNCP24863 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNCP24863 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNCP24863 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNCP24863 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNCP24863 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNCP24863 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNCP24863 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNCP24863 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNCP24863 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNCP24863 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNCP24863 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNCP24863 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNCP24863 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNCP24863 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNCP24863 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNCP24863 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNCP24863 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNCP24863 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNCP24863 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNCP24863 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNCP24863 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNCP24863 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNCP24863 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNCP24863 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNCP24863 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms