Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP4AP20648 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP4AP20648 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms