Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XBP1P17861 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
XBP1P17861 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
XBP1P17861 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XBP1P17861 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XBP1P17861 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XBP1P17861 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
XBP1P17861 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XBP1P17861 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XBP1P17861 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XBP1P17861 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XBP1P17861 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XBP1P17861 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XBP1P17861 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XBP1P17861 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
XBP1P17861 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
XBP1P17861 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XBP1P17861 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XBP1P17861 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XBP1P17861 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XBP1P17861 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XBP1P17861 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XBP1P17861 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XBP1P17861 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
XBP1P17861 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XBP1P17861 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XBP1P17861 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XBP1P17861 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XBP1P17861 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XBP1P17861 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XBP1P17861 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XBP1P17861 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XBP1P17861 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
XBP1P17861 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
XBP1P17861 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XBP1P17861 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XBP1P17861 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XBP1P17861 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XBP1P17861 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XBP1P17861 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
XBP1P17861 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XBP1P17861 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
XBP1P17861 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
XBP1P17861 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XBP1P17861 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XBP1P17861 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
XBP1P17861 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
XBP1P17861 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
XBP1P17861 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
XBP1P17861 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
XBP1P17861 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
XBP1P17861 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
XBP1P17861 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
XBP1P17861 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
XBP1P17861 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
XBP1P17861 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XBP1P17861 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XBP1P17861 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XBP1P17861 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XBP1P17861 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XBP1P17861 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XBP1P17861 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XBP1P17861 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XBP1P17861 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XBP1P17861 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XBP1P17861 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XBP1P17861 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XBP1P17861 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XBP1P17861 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XBP1P17861 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XBP1P17861 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XBP1P17861 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XBP1P17861 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XBP1P17861 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XBP1P17861 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XBP1P17861 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XBP1P17861 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XBP1P17861 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XBP1P17861 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XBP1P17861 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XBP1P17861 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XBP1P17861 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XBP1P17861 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XBP1P17861 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XBP1P17861 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XBP1P17861 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XBP1P17861 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XBP1P17861 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XBP1P17861 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XBP1P17861 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XBP1P17861 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XBP1P17861 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XBP1P17861 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
XBP1P17861 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XBP1P17861 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XBP1P17861 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XBP1P17861 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XBP1P17861 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XBP1P17861 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
XBP1P17861 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms