Protein–RNA interactions for Protein: P0DN78

OPN1MW3, Medium-wave-sensitive opsin 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1MW3P0DN78 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OPN1MW3P0DN78 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN1MW3P0DN78 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms