Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SERPINC1P01008 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERPINC1P01008 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms