Protein–RNA interactions for Protein: O95361

TRIM16, Tripartite motif-containing protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16O95361 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM16O95361 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM16O95361 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms