Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA10O75578 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA10O75578 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA10O75578 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA10O75578 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA10O75578 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA10O75578 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA10O75578 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA10O75578 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA10O75578 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA10O75578 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA10O75578 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA10O75578 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA10O75578 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA10O75578 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA10O75578 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA10O75578 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA10O75578 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA10O75578 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA10O75578 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA10O75578 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA10O75578 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA10O75578 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA10O75578 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA10O75578 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA10O75578 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA10O75578 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA10O75578 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA10O75578 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA10O75578 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGA10O75578 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA10O75578 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA10O75578 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA10O75578 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA10O75578 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA10O75578 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA10O75578 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA10O75578 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA10O75578 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA10O75578 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA10O75578 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA10O75578 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA10O75578 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms