Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRC1O43663 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRC1O43663 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRC1O43663 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRC1O43663 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRC1O43663 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRC1O43663 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRC1O43663 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRC1O43663 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRC1O43663 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRC1O43663 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRC1O43663 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRC1O43663 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRC1O43663 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRC1O43663 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRC1O43663 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRC1O43663 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRC1O43663 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRC1O43663 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRC1O43663 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRC1O43663 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRC1O43663 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRC1O43663 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRC1O43663 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRC1O43663 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRC1O43663 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRC1O43663 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRC1O43663 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRC1O43663 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRC1O43663 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRC1O43663 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRC1O43663 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PRC1O43663 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRC1O43663 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRC1O43663 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRC1O43663 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRC1O43663 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRC1O43663 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRC1O43663 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRC1O43663 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRC1O43663 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRC1O43663 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRC1O43663 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRC1O43663 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRC1O43663 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRC1O43663 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRC1O43663 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRC1O43663 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRC1O43663 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRC1O43663 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRC1O43663 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRC1O43663 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRC1O43663 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRC1O43663 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRC1O43663 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRC1O43663 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRC1O43663 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRC1O43663 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRC1O43663 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRC1O43663 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRC1O43663 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRC1O43663 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRC1O43663 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRC1O43663 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRC1O43663 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRC1O43663 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRC1O43663 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRC1O43663 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRC1O43663 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRC1O43663 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRC1O43663 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRC1O43663 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRC1O43663 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRC1O43663 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRC1O43663 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PRC1O43663 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PRC1O43663 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PRC1O43663 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PRC1O43663 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRC1O43663 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRC1O43663 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRC1O43663 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRC1O43663 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRC1O43663 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRC1O43663 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRC1O43663 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRC1O43663 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRC1O43663 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRC1O43663 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRC1O43663 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRC1O43663 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRC1O43663 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRC1O43663 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRC1O43663 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRC1O43663 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRC1O43663 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRC1O43663 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRC1O43663 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRC1O43663 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRC1O43663 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms