Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEFVO15553 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MEFVO15553 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEFVO15553 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MEFVO15553 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEFVO15553 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEFVO15553 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEFVO15553 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEFVO15553 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEFVO15553 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEFVO15553 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEFVO15553 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEFVO15553 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEFVO15553 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEFVO15553 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEFVO15553 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEFVO15553 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEFVO15553 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEFVO15553 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEFVO15553 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEFVO15553 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEFVO15553 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEFVO15553 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEFVO15553 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MEFVO15553 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEFVO15553 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEFVO15553 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEFVO15553 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEFVO15553 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEFVO15553 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEFVO15553 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEFVO15553 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEFVO15553 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEFVO15553 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEFVO15553 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEFVO15553 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEFVO15553 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEFVO15553 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEFVO15553 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEFVO15553 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEFVO15553 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEFVO15553 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEFVO15553 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEFVO15553 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEFVO15553 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEFVO15553 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEFVO15553 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEFVO15553 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEFVO15553 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEFVO15553 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEFVO15553 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEFVO15553 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEFVO15553 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEFVO15553 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEFVO15553 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEFVO15553 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEFVO15553 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEFVO15553 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEFVO15553 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEFVO15553 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MEFVO15553 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MEFVO15553 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEFVO15553 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEFVO15553 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEFVO15553 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEFVO15553 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEFVO15553 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEFVO15553 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEFVO15553 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEFVO15553 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEFVO15553 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEFVO15553 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEFVO15553 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEFVO15553 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEFVO15553 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MEFVO15553 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEFVO15553 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEFVO15553 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEFVO15553 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MEFVO15553 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEFVO15553 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEFVO15553 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEFVO15553 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEFVO15553 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEFVO15553 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MEFVO15553 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEFVO15553 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEFVO15553 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEFVO15553 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEFVO15553 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEFVO15553 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEFVO15553 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEFVO15553 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEFVO15553 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEFVO15553 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEFVO15553 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEFVO15553 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEFVO15553 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEFVO15553 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEFVO15553 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms