Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIMBP2O15034 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms