Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLGNO14967 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLGNO14967 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLGNO14967 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLGNO14967 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLGNO14967 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLGNO14967 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLGNO14967 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLGNO14967 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLGNO14967 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLGNO14967 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLGNO14967 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLGNO14967 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLGNO14967 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLGNO14967 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLGNO14967 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLGNO14967 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLGNO14967 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLGNO14967 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLGNO14967 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLGNO14967 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLGNO14967 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLGNO14967 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLGNO14967 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLGNO14967 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLGNO14967 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLGNO14967 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLGNO14967 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLGNO14967 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLGNO14967 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLGNO14967 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLGNO14967 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLGNO14967 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLGNO14967 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLGNO14967 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLGNO14967 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLGNO14967 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLGNO14967 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLGNO14967 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLGNO14967 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLGNO14967 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLGNO14967 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLGNO14967 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLGNO14967 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLGNO14967 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLGNO14967 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLGNO14967 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLGNO14967 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLGNO14967 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLGNO14967 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLGNO14967 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLGNO14967 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLGNO14967 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLGNO14967 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLGNO14967 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLGNO14967 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLGNO14967 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLGNO14967 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLGNO14967 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLGNO14967 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLGNO14967 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLGNO14967 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLGNO14967 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLGNO14967 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLGNO14967 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLGNO14967 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLGNO14967 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLGNO14967 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLGNO14967 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLGNO14967 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLGNO14967 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLGNO14967 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLGNO14967 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLGNO14967 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLGNO14967 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLGNO14967 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLGNO14967 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLGNO14967 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLGNO14967 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLGNO14967 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLGNO14967 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLGNO14967 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLGNO14967 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLGNO14967 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLGNO14967 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLGNO14967 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLGNO14967 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLGNO14967 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLGNO14967 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLGNO14967 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLGNO14967 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLGNO14967 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLGNO14967 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLGNO14967 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLGNO14967 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLGNO14967 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLGNO14967 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLGNO14967 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLGNO14967 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLGNO14967 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms