Protein–RNA interactions for Protein: O14910

LIN7A, Protein lin-7 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7AO14910 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN7AO14910 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
LIN7AO14910 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN7AO14910 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN7AO14910 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN7AO14910 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN7AO14910 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN7AO14910 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN7AO14910 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN7AO14910 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN7AO14910 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN7AO14910 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN7AO14910 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN7AO14910 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN7AO14910 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN7AO14910 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN7AO14910 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms