Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
STX16-NPEPL1H3BU86 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms