Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C6orf229H3BNL8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C6orf229H3BNL8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
C6orf229H3BNL8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C6orf229H3BNL8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C6orf229H3BNL8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C6orf229H3BNL8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
C6orf229H3BNL8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
C6orf229H3BNL8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C6orf229H3BNL8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
C6orf229H3BNL8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C6orf229H3BNL8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C6orf229H3BNL8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C6orf229H3BNL8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C6orf229H3BNL8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C6orf229H3BNL8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
C6orf229H3BNL8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C6orf229H3BNL8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C6orf229H3BNL8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C6orf229H3BNL8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C6orf229H3BNL8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
C6orf229H3BNL8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C6orf229H3BNL8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C6orf229H3BNL8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms