Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PBE3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PBE3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PBE3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PBE3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PBE3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PBE3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PBE3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PBE3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PBE3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PBE3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PBE3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PBE3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PBE3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PBE3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PBE3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PBE3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PBE3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PBE3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PBE3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PBE3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PBE3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PBE3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PBE3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PBE3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PBE3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PBE3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PBE3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PBE3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PBE3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PBE3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PBE3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PBE3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PBE3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PBE3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PBE3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PBE3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PBE3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PBE3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PBE3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PBE3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PBE3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PBE3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PBE3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PBE3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PBE3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PBE3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PBE3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PBE3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PBE3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PBE3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PBE3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PBE3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PBE3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PBE3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PBE3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PBE3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PBE3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PBE3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PBE3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PBE3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PBE3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PBE3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PBE3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PBE3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PBE3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PBE3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PBE3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PBE3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PBE3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PBE3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PBE3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PBE3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PBE3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PBE3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PBE3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PBE3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PBE3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PBE3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PBE3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PBE3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PBE3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PBE3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PBE3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PBE3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PBE3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PBE3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PBE3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PBE3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PBE3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PBE3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PBE3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PBE3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PBE3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PBE3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PBE3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PBE3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PBE3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PBE3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PBE3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms