Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM1B2RUZ4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms