Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VGLL3A8MV65 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms