Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXY3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXY3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A0J9YXY3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YXY3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms