Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ABCC13Q9NSE7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCC13Q9NSE7 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms