Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C9orf16Q9BUW7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C9orf16Q9BUW7 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C9orf16Q9BUW7 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C9orf16Q9BUW7 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf16Q9BUW7 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C9orf16Q9BUW7 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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C9orf16Q9BUW7 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf16Q9BUW7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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