Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 LINC01973-201ENST00000374983 4678 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 GRM4-209ENST00000609222 3176 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CSPG4P12-201ENST00000558282 4853 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ENOX2-201ENST00000338144 4263 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 C10orf105-201ENST00000398786 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP30-201ENST00000368013 4394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms