Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms